floristic			package: unknown		 R Documentation

			
				Busca os nomes dos autores de espcies de angiospermas 

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Descrio
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Esta funo l uma lista de espcies de angiospermas e retorna a mesma lista de espcies acrescida dos nomes dos autores de cada uma.

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Uso
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floristic(lista,coluna=2, bd="brasil",csv=TRUE, familia=FALSE, grafico=FALSE)

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Argumentos
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lista	uma matriz ou um data frame de caracteres ou fator contendo a lista de espcies. Cada espcie deve estar em uma linha da mesma coluna.

coluna	nmero da coluna que contm os nomes das espcies, o defalt   2.

bd	banco de dados a ser utilizados para busca. O default  um banco com os nomes das espcies de angiospermas do Brasil.
	Os nomes aceitos so: 
	"brasil" (todas as plantas do Brasil), 
	"norte" (plantas que ocorrem na regio Norte do Brasil)
	"nordeste" (plantas que ocorrem na regio Nordeste do Brasil)
	"centro-oeste" (plantas que ocorrem na regio Centro-Oeste do Brasil)
	"sudeste" (plantas que ocorrem na regio Sudeste do Brasil)
	"sul" (plantas que ocorrem na regio Sul do Brasil)

csv	se TRUE, a funo cria um arquivo de exteno CSV no seu diretrio de trabalho. Note que o default  FALSE.

familia 	se consta em lista o nome das famlias de cada espcie, ento este argumento deve ser TRUE. Os nomes das famlias devem estar na primeira coluna. O default  FALSE.

grafico 	 este argumento s ter efeito se familia for TRUE. Caso seja TRUE, retornar um grfico com as 8 famlias de maior riqueza de espcies.
 
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Detalhes
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 recomendada a utilizao do argumento familia=TRUE para que seja possvel colocar o nome das famlias de cada espcie, bem como um grfico diagnstico que mostra as famlias com maior riqueza.
Recomenda-se fortemente retirar os "cf." ou "aff." das espcies, pois pode impedir a busca correta da espcie no banco de dados.

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Valor
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O objeto de sada  um data frame com a primeira coluna contendo o nome das famlias, a segunda coluna contendo o nome das espcies e a terceira coluna contendo um "*" onde tiver uma espcie no encontrada no banco de dados. 

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Autor:
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Rocha, Diogo S. B.
diogosbr@gmail.com

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Referncias
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Lista de Espcies da Flora do Brasil 2013 in  http://floradobrasil.jbrj.gov.br

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Veja tambm
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Exemplos
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teste=data.frame(Famlia=c("Fabaceae"  , "Myrtaceae"   , "Asteraceae"  , "Rosaceae" , "Elaeocarpaceae" , "Meliaceae" ,  "Bignoniaceae" , "Melastomataceae",
 "Lauraceae"   ,"Myrtaceae" , "Sapindaceae"  , "Cyatheaceae"  , "Fabaceae" , "Polygonaceae"  , "Melastomataceae" ,"Myrtaceae" ,
"Solanaceae"  ,  "Myrtaceae",   "Lauraceae"  , "Myrtaceae" , "Annonaceae"  ),
Espcie= c("Copaifera trapaezifolia" , "Eugenia itapemirimensis" ,  "Vernonanthura diffusa"  ,   "Prunus myrtifolia"     ,    "Sloanea guianensis",       
 "Cabralea canjerana"  ,    "Handroanthus heptaphyllus" ,"Leandra melastomoides"   ,  "Ocotea daphinifolia"  ,     "Campomanesia dichotoma"   ,
"Paullinia carpopoda"    ,   "Alsophila setosa"    ,    "Fabaceae sp01 " ,  "Cocoloba mosenii"   ,  "Miconia tristis",       
"Plinia sp01"  ,   "Solanum rupincola"  ,  "Myrceugenia pilotantha" , "Aniba sp02"  , "Eugenia sp05" ,    "Guatteria pogonopus" ) )

result=floristic (teste, coluna=2 )
head(result)

result=floristic (teste, familia=TRUE, grafico=TRUE )


